ANÁLISE IMUNOINFORMÁTICA DE EPÍTOPOS ULTRACONSERVADOS EM CORONAVÍRUS HUMANOS E ANIMAIS PARA O DESENVOLVIMENTO DE VACINAS UNIVERSAIS

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Resumo

Introdução: A emergência recorrente de coronavírus zoonóticos, como SARS-CoV, MERS-CoV e SARS-CoV-2, evidencia a necessidade de estratégias vacinais capazes de conferir proteção ampla contra diferentes membros da família Coronaviridae. Embora as vacinas atuais sejam predominantemente direcionadas à proteína Spike, proteínas não estruturais envolvidas na replicação viral apresentam maior conservação evolutiva e podem constituir alvos promissores para vacinas baseadas em linfócitos T. A identificação de epítopos conservados entre coronavírus humanos e animais pode contribuir para o desenvolvimento de vacinas universais capazes de induzir a imunidade celular cruzada. Objetivos: Identificar peptídeos conservados entre coronavírus humanos e animais com potencial imunogênico para resposta mediada por células T, avaliando sua conservação, processamento antigênico e capacidade predita de apresentação por moléculas HLA de classe I. Métodos: Foram selecionadas sequências representativas de coronavírus que infectam humanos, cão, gato, bovino, suíno, cavalo, camundongo, vison e beluga, incluindo HCoVs sazonais, SARS-CoV, SARS-CoV-2 e MERS-CoV. Os alinhamentos múltiplos foram realizados utilizando o software MAFFT. Foram selecionados peptídeos com identidade de 100% e comprimento mínimo de nove aminoácidos. Os candidatos foram classificados em três grupos: conservados universalmente, conservados entre coronavírus de mamíferos e conservados entre coronavírus humanos. A imunogenicidade potencial foi avaliada por ferramentas do Immune Epitope Database (IEDB), incluindo predição de clivagem proteassomal, transporte via TAP, ligação a moléculas HLA classe I e frequência populacional dos alelos HLA correspondentes. Resultados: Foram identificados dois peptídeos universalmente conservados, ambos localizados na RNA polimerase dependente de RNA (NSP12): LMGWDYPKCDRA (motivo catalítico A) e GPHEFCSQH (motivo catalítico E). Adicionalmente, foram identificados seis peptídeos conservados entre coronavírus de mamíferos e sete entre coronavírus humanos, predominando nas proteínas NSP12, NSP13 e NSP16. Diversos candidatos coincidiram com regiões funcionalmente críticas da polimerase viral, incluindo os motivos A, C, E e G. Entre os epítopos derivados desses peptídeos, destacaram-se VVIGTTKFY, LSDDGVVCY e KFGKARLYY, que apresentaram elevada probabilidade de processamento antigênico e ligação a múltiplos alelos HLA. O epítopo SLAIDAYPL demonstrou afinidade predita para HLA-A02:01, alelo com frequência estimada de 20,07%, enquanto NRFNVAITR, derivado da NSP13, apresentou ligação predita a diversos alelos HLA-A, incluindo HLA-A33:01 e HLA-A*31:01. Os resultados indicam potencial cobertura populacional relevante para alguns dos candidatos identificados. Conclusão: A busca por regiões ultraconservadas revelou um conjunto restrito, porém biologicamente relevante, de candidatos vacinais concentrados em proteínas do complexo de replicação viral. A associação desses peptídeos com domínios funcionalmente essenciais, aliada ao potencial de apresentação por alelos HLA frequentes na população, sugere que proteínas não estruturais, especialmente NSP12 e NSP13, constituem alvos promissores para o desenvolvimento de vacinas universais baseadas em resposta celular contra coronavírus.